Eu tambem estava com essa mesma dúvida!! Realmente.. o joomla não faz isso sozinho!
Existe um componente chamado YooZOO, tem a versao free dele no site (procure no google) que voce cadastra as categorias dentro deste componente e os itens de conteudo (ele nao importa as categorias do joomla) e permite associar 1 item em duas categorias!
Mas detalhe.. nao há como criar seção.. nao há como listar todas as categorias (se descobrir, por favor me avise), e uma coisa, quando voce mandar procurar por um item em duas categorias, o que acha que acontece? Isso.... ele aparece duas veses!! Eu resolvi de outra forma, mas para o meu caso nao era realmente necessario ter os itens nas duas categorias, entao fiz um link rementendo de o item de uma categoria a outra.