Organização de banco de dados

[lularibeiro]

Amigos,

tenho um projeto que funciona assim:

"Alugo" ecommerce do tipo:

Loja = nomedosite.com.br/nomedaloja1 (banco de dados 1 - tabela 1)
Loja = nomedosite.com.br/nomedaloja2 (banco de dados 1 - tabela 2)

O site pai seria o nomedosite.com.br que teria uma busca em todas as tabelas das lojas dando como resultado os produtos buscados pelo usuário.

A pergunta é:

Como seto essa busca do site pai para buscar apenas os produtos do banco de dado 1 das tabelas 1 e 2?
Seria melhor fazer tudo, inclusive o site em tabelas diferentes?

Agradeço a ajuda.

Lula Ribeiro