Olá,
Já há uma nova versão do plugin (1.9) com a correção para esta questão introduzida pelas últimas versões do VirtueMart 2 (2.0.20+).
Antes da versão 2.0.20 o VirtueMart armazenava no banco de dados o valor dos descontos aplicados por cupons como se fosse um valor positivo criando a necessidade de se fazer uma conversão. Agora o VirtueMart faz a armazenagem do valor do desconto de maneira correta, ou seja, armazena o valor como um valor negativo, afinal é um desconto.
Esta nova versão tem algumas novidades e correções que podem ser verificadas no arquivo "Changelog.txt" que acompanha o pacote.
Basta acessar sua conta no site e baixar o arquivo do plugin novamente, já atualizado.
Abraços